UASB厭氧反應器與IC厭氧反應器在運行上有很大的差別，主要表現在抗沖擊負荷方面，IC厭氧反應器可以通過內循環自動稀釋進水，使反應室的進水濃度穩定性。其次是它需要較短的停留時間，對可生化性好的廢水的確是優點。另外IC厭氧反應器優點還有很多，特別是對于高SS進水，比UASB厭氧反應器明顯，由于IC厭氧反應器上升流速很大，SS不會在反應器內大量積累，污泥可以保持較高活性。

IC厭氧反應器有許多方面優于UASB厭氧反應器，是否UASB厭氧反應器就不選擇了呢？

IC厭氧反應器雖然有諸多的優點，但也存在缺點。尤其在污水可生化性不是太好的情況下，由于水力停留時間比較短去除率遠沒有UASB厭氧反應器高，從而增加了耗氧的負擔。另外，IC厭氧反應器由于氣體內循環，特別是對進水水質不太穩定的，導致IC厭氧反應器出水水量不穩定，出水水質也相對不穩定，時可能還會出現短暫不出水現象，對后序處理工藝是影響的。UASB厭氧反應器比IC厭氧反應器突出優點就是去除率高，出水水質相對穩定。因此，在選擇IC厭氧反應器與UASB厭氧反應器的時候要根據實際情況來選擇，才能發揮出各自的優點。

應用

適用于有機高濃度廢水，如，玉米淀粉廢水、檸檬酸廢水、啤酒廢水、土豆加工廢水、酒精廢水的處理；還適用于造紙、垃圾滲濾液、食品加工、醫藥化工等的處理。